Gece baş ağrısı, ağrı ile uyku arasındaki yakın ilişkiyi gözler önüne serer. Bu ilişki iki şekilde değerlendirilebilir: Bazı durumlarda ağrı uyku sırasında ortadan kaybolurken, bazen de uyku anında ya da sonrasında ortaya çıkabilir. Migren sorunu yaşayan kişiler, genellikle sakin ve karanlık bir ortamda kalmayı tercih ederler. Eğer bu esnada uykuya geçiş sağlanabilirse, çoğu zaman baş ağrısı uyandıktan sonra ortadan kaybolabilir. Ancak, bazen de baş ağrısı olmadan uyuyan bir kişi, inanılmaz bir baş ağrısı ile uykudan uyanabilir.

Uyku apnesi ile baş ağrısı arasında bir ilişki olduğu düşünülmektedir. Gece nefes durması yaşayan kişilerde baş ağrısı görülme sıklığı daha fazladır. Vücudun fonksiyonlarını tam olarak yerine getirebilmesi için oksijen olmazsa olmazdır. Oksijenin yeterli oranda ulaşmadığı bir beyinde baş ağrısı yaşanması kaçınılmaz olur. Özellikle sabahları uyandığında daha çok hissedilen bir baş ağrısı yaşanır. Bu ağrı başın tümünde, baskı uygular şekilde hissedilebilir ve yarım ila bir saat içinde genellikle ortadan kaybolur.

Uyku apnesi, küme baş ağrısı tipi ile de bağlantılı olarak seyredebilir. Küme baş ağrısı, tek taraflı hissedilen, göz ve alın bölgesinde bazen gece bazen gündüz düzenli aynı saatlerde ortaya çıkabilen bir ağrı türüdür. Gözde kızarma, sulanma, burunda akıntı ile seyredebilir. Küme baş ağrısı genetik olarak ortaya çıkabilir.

Geceleri uykudan uyandıran baş ağrılarının diğer bir sebebi de beyin tümörleridir. Toplumda beyin tümörü görülme sıklığı %1 oranındadır. Tümör, kist, beyinde sıvı birikimi, enfeksiyon, damar genişlemesi ya da kanama gibi sorunlardan dolayı ortaya çıkabilir. Bu tür rahatsızlıklar nedeniyle oluşan baş ağrıları başın tamamını kaplayabilir ve basit ağrı kesiciler ile çözüm getirilemez. Bu ağrılar o kadar şiddetlenebilir ki gece ağrı nedeniyle uykudan uyanılabilir. Baş ağrılarında en önemli olanları gece uykudan uyandıracak şiddette olanlardır. Beyin ile ilgili sorun yaşayanlarda baş ağrısı ile birlikte fışkırır tarzda kusma da yaşanabilir. Uyuşukluk, felç, kanama gibi semptomlar baş ağrısına eşlik edebilir.

Göz ile ilgili gelişen astigmat, miyop gibi rahatsızlıklar da baş ağrısına yol açabilir. Bu tip ağrılar da gece uykudan uyandırabilecek kadar yoğun yaşanabilir.

Gece uykudan uyandırabilecek baş ağrısının bir diğer nedeni de çene eklemi hastalığıdır. Özellikle uyku sırasında dişlerini sıkan kişilerde görülür. Dişlerin sıkılması şakaklarda ciddi anlamda ağrıya yol açabilir. Böyle bir sorunu olan kişiler mutlaka bir doktora başvurarak ilaç tedavisine başlamalıdır. Ayrıca geceleri dişlik kullanmak da sorunu kontrol altına almak için faydalı olabilir.

Sağlıklı bir yaşama için sağlıklı bir uyku hayatın vazgeçilmezlerindendir. Uyku ile ilgili gelişen baş ağrılarında mutlaka nörolojik bir uzmana başvurmak ve sorunları gidermek önemlidir.