Gece baş ağrısı, ağrı ile uyku arasında yakın bir ilişki olduğu bilinmektedir. Ağrı ile uyku arasındaki ilişki iki şekilde değerlendirilebilir. Bazen ağrı uyuduktan sonra ortadan kaybolurken, bazen uyku anında ya da sonrasında da ortaya çıkabilir. Migren sorunu yaşayan kişiler sakin ve karanlık bir ortamda kalmayı tercih ederler. Eğer bu arada uykuya geçiş sağlanabilirse çoğu zaman baş ağrısı uyandıktan sonra ortadan kaybolabilir. Bazen de hiç baş ağrısı olmadan uyuyan bir kişi inanılmaz bir baş ağrısı ile uykudan uyanabilir.

Uyku apnesi ve baş ağrısı arasında bir ilişki olduğu düşünülmektedir. Gece nefes durması yaşayan kişilerde baş ağrısı görülme sıklığı daha fazladır. Vücudun fonksiyonlarını tam olarak yerine getirebilmesi için oksijen olmazsa olmazlardandır. Oksijenin yeterli oranda ulaşmadığı bir beyinde baş ağrısı yaşanması kaçınılmaz olur. Özellikle sabahları uyanıldığında daha çok hissedilen bir baş ağrısı yaşanır. Bu ağrı başın tümünde, baskı uygular şekilde hissedilebilir. Ağrı yarım ila bir saat içinde genelde ortadan kaybolur.

Uyku apnesi küme baş ağrısı tipi ile de bağlantılı olarak seyredebilir. Küme baş ağrısı tek taraflı hissedilen, göz ve alın bölgesinde bazen gece bazen gündüz düzenli aynı saatlerde ortaya çıkabilen bir ağrı türüdür. Gözde kızarma, sulanma, burunda akıntı ile seyredebilir. Küme baş ağrısı genetik olarak ortaya çıkabilir.

Geceleri uykudan uyandıran baş ağrılarının diğer bir sebebi de beyin tümörleridir. Toplumda beyin tümörü görülme sıklığı %1 oranındadır. Tümör, kist, beyinde sulanma, enfeksiyon, damar genişliği ya da kanama gibi sorunlardan dolayı ortaya çıkabilir. Bu tür rahatsızlıklar dolayısı ile oluşan baş ağrıları başın tamamını kaplayabilir ve basit ağrı kesiciler ile soruna çözüm getirilemez. Bu ağrılar o kadar şiddetlenebilir ki gece ağrı nedeni ile uykudan uyanılabilir. Baş ağrılarında en önemli olanları gece uykudan uyandıracak şiddette olanlardır. Beyin ile alakalı sorun yaşayanlarda baş ağrısı ile fışkırırcasına kusma da yaşanabilir. Uyuşukluk, felç, kanama gibi semptomla baş ağrısına eşlik eder.

Göz ile alakalı gelişen astigmat, miyop gibi rahatsızlıklar da baş ağrısına yol açabilir. Bu tip ağrılarda gece uykudan uyandırabilecek kadar yoğun yaşanabilir.

Gece uykudan uyandırabilecek baş ağrısının bir diğer nedeni de çene eklemi hastalığıdır. Özellikle uyku sırasında dişlerini sıkan kişilerde görülür. Dişlerin sıkılması şakaklarda ciddi anlamda ağrıya yol açabilir. Böyle sorunu olan kişiler mutlaka bir doktora başvurarak ilaç tedavisine başlamalıdır. Ayrıca geceleri dişlik kullanmakta sorunu kontrol altına almak için faydalı olabilir.

Sağlık bir yaşama için sağlıklı bir uyku hayatın vazgeçilmezlerindendir. Uyku ile alakalı gelişen baş ağrılarında mutlaka nörolojik bir uzmana başvurmak ve sorunları giderme önemlidir.